Les organes de la Société des gynécologues obstétriciens du Burkina sont :

l’assemblée générale, le bureau exécutif et les comités.

L’Assemblée Générale est l’organe suprême de l’association. Elle réunit les membres titulaires à jour de leur cotisation ;
les membres d’honneur et associés y participant à titre d’observateur.
Le Bureau Exécutif renouvelable tous les deux (2) ans est composé de :

• Un Président
• Le président sortant
• Un vice-président
• Un Secrétaire Général
• Un Secrétaire Général Adjoint
• Un Trésorier Général
• Un Trésorier Général Adjoint
• Les coordonnateurs des différents projets de la SOGOB
  
  

Les Comités de la SOGOB sont les suivants :

• Le comité scientifique, il est chargé de la recherche, de la promotion et de la vulgarisation scientifique. Ce comité est élu lors de l’Assemblée Générale.
• Le comité d’éthique est surtout composé d’anciens présidents de la SOGOB, de membres honoraires et de gynécologues obstétriciens qui ne sont plus en pratique active
• Les autres comités jugés utiles par l’Assemblée Générale.